Kernenergiedeskundigen Burnie en Dr. Barnaby onderzochten in opdracht van Greenpeace de effecten van de aanwezigheid van MOX-brandstof op het verloop van de kernramp in Fukushima. Zij concludeerden dat wanneer alle drie de reactoren volgens plan 30 procent MOX hadden bevat, de gevolgen van de kernramp veel ernstiger waren geweest. Ten tijde van de ramp zat enkel in de derde reactor 5,4 procent MOX-brandstof. Het koelen van deze reactor is problematischer en uit reactor 3 zijn hoogstwaarschijnlijk meer radioactieve stoffen vrijgekomen. In Japan is het MOX-programma ernstig vertraagd door veiligheidsschandalen en protesten van de lokale bevolking.
Bij de verwerking van kernafval uit kerncentrale Borssele wordt plutonium afgescheiden. Tot nu toe betaalde Borssele de Franse afvalverwerkingsfabriek om van dit levensgevaarlijke materiaal af te komen, maar in de toekomst wil Frankrijk het niet meer hebben. Daarom moet Borssele nu zelf plutoniumbrandstof gaan gebruiken, ondanks alle nadelen. Zo zullen de transporten met brandstof zwaar bewaakt moeten worden omdat met enkele kilogrammen plutonium al een kernbom gemaakt kan worden. Ook blijft Borssele straks met extra gevaarlijk kernafval zitten. Opgebrande MOX kan niet in Frankrijk verwerkt worden.
Het beroep tegen de MOX vergunning wordt mede ingediend door de Natuur en Miliefederaties waaronder de Zeeuwse Milieufederatie en een groep omwonenden van de kerncentrale.